Die Fachausschüsse sind die zentralen fachlichen Gremien innerhalb der Liga. In diesen verbandsübergreifenden Arbeitsrunden werden Themen der Arbeitsbereiche diskutiert, aktuelle sozial- und bildungspolitische Entwicklungen kommentiert und gemeinsame Positionen erarbeitet. Die Mitglieder wirken zudem in offiziellen Gremien des Freistaates Sachsen und anderer Institutionen auf Landesebene mit.

Mitglieder sind die Fachreferate der einzelnen Verbände. Analog des alle zwei Jahre rotierenden Vorsitzes der Liga übernehmen die Fachreferent*innen des vorsitzenden Verbandes in dieser Zeit die Leitung ihres Fachausschusses und die Sprecherfunktion für die Anliegen der Liga im Fachbereich. Ihnen obliegt jeweils die inhaltliche und organisatorische Umsetzung der Gremienarbeit.